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Term | Definition |
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Indice de diversité | ♦ Coefficient traduisant le degré de diversité d'une communauté. Son expression est fonction de deux paramètres : le nombre d'espèces et le nombre d'individus par espèce. Il existe une multitude d'indices mais le plus couramment utilisé est celui de Shannon et Weaver (1949) qui exprime l'importance relative du nombre des espèces abondantes dans un milieu donné. Ainsi, plus la proportion des espèces rares est forte et celle des espèces abondantes réduite, plus l'indice de diversité est grand. L'indice est minimum quand tous les individus appartiennent à la même espèce ; il est maximum quand chaque individu représente une espèce distincte. > Les différents indices de diversité sont les suivants : Index de Diversité maximale (H) Hmax= log2 où S est la richesse exprimée en nombre d'espèces Indice de Shannon Indice permettant de mesurer la biodiversité. Il est fondé sur la notion d'entropie (entropie de Shannon). H' = -∑ (ni / N) log2 (ni / N) où ni est le nombre d'individus de l'espèce du rang i N est le nombre total des individus Il est possible de choisir arbitrairement la base du logarithme et on trouve donc souvent dans la littérature scientifique log ou log de base 2 à la place de ln. ♦ Synonyme : Indice de biodiversité. ♦ Équivalent étranger : (Bio)Diversity index. |
Indice de diversité de Hill | ♦ Il s'agit d'une mesure permettant d'associer les indices de Shannon-Wiener et de Simpson (Grall et Hily, 2005). > Type de répartition δ² = ∑ (ni - m) ²/ n-1 où • ni est le nombre d'individus de l'espèce du relevé i pris en considération Cet indice est le plus souvent utilisé dans le but de connaître le mode de répartition de l'espèce dans un milieu donné.
> Équitabilité J' = H' / Hmax = H' / log2 S Cet indice rend compte de l'équirépartition des individus par espèce, J’ varie entre 0 (abondance d'une seule espèce dans le peuplement) et 1 (le nombre d'individus par espèce est presque le même). Les principaux indices d'équitabilité consistent à établir le rapport entre la diversité mesurée et la diversité théorique maximale. La valeur du nombre total d'espèces de la population échantillonnée reste pratiquement impossible à déterminer. Il est donc d'usage de prendre le nombre total d'espèces de l'échantillon comme valeur. Cette valeur sous-estimant le nombre réel d'espèces et étant fortement dépendante de la taille des échantillons, l'équitabilité se trouve toujours surestimée. En fonction de l'indice de diversité sur lequel il est calculé, l'indice d'équitabilité donnera plus ou moins de poids aux espèces rares (indice de Shannon) ou abondantes (indice de Simpson). > Amplitude d’habitat AH = eH' où • e est la base des logarithmes népériens Ce paramètre varie de 1 à n (pour n milieux étudiés). AH vaut 1 quand l'espèce n'est présente que dans un milieu et n quand l'espèce est répandue de manière égale dans les n milieux. - Indice de similarité de Jaccard - Définit la similitude comme étant l'importance de remplacement des espèces ou les changements biotiques à travers les gradients environnementaux. Il permet une comparaison entre deux sites, car il évalue la ressemblance entre deux relevés en faisant le rapport entre les espèces communes aux deux relevés et celles propres à chaque relevé. Jij = c / ( a+b+c) où • a est le nombre d'espèces communes au relevé i et au relevé j Cet indice varie de 0 à 1 et ne tient compte que des associations positives. - Indice patrimonial - α = 1/Qi où • Qi est l'occurrence de l'espèce i. Σα où N est le nombre d'espèces de la communauté i est le poids de l'ième espèce, et max et min sont les poids maximum et minimum définis précédemment. ♦ Équivalent étranger : Diversity Hill index. |
Indice de Levins | ♦ Il permet de mesurer l’amplitude de la niche écologique en évaluant la proportion de l’habitat utilisé par une espèce. B = 1 / Σ pi² où • B est la mesure de l’amplitude de niche ♦ Équivalent étranger : Levins’ index. |
Indice de Margalef | ♦ Cet indice de richesse spécifique (noté RMg) permet d’estimer la richesse spécifique absolue, indépendamment de la taille de l’échantillon. Il est utilisé pour vérifier la diversité dans différents sites, a l’avantage de ne pas avoir de seuil défini et permet aussi de pondérer la taille des échantillons. Cet indice est simple à calculer mais il peut s’avérer très dépendant de l’effort d’échantillonnage. RMg = S -1/ ln (N) où • N est le nombre d’individus ♦ Équivalent étranger : Margalef index. |
Indice de rareté relative | ♦ Défini comme étant l’importance moyenne de la rareté des individus de toutes les espèces dans la communauté considérée et qui prend des valeurs comprises entre 0 (pas d’espèce rare dans la communauté) et 1 (tous les individus de la communauté appartiennent à des espèces rares) : IRR = ([Σ(ai x wMi) / N] - wmin) / (wmax – wmin) où • ai est sont respectivement l’abondance des iièmes espèces de la communauté ♦ Équivalent étranger : Index of relative rarity (IRR). |
Indice de réaction à l’effet de serre | ♦ Indice développé par le Centre national de données sur le climat des États-Unis, et qui inclut les variables suivantes : températures très supérieures à la normale, précipitations très supérieures à la normale pendant les mois froids, sécheresse extrême ou sévère au cours des mois chauds, plus grande proportion que la normale de précipitations quotidiennes de plus de 50,8 millimètres, et réduction des écarts de températures d'un jour à l'autre. |
Indice de saprobité | ♦ Méthode de classement biologique des eaux polluées qui s'appuie sur la présence de certains organismes saprobies indicateurs de pollution organique. |
Indice de similarité de Jaccard | ♦ Définit la similitude comme étant l’importance de remplacement des espèces ou les changements biotiques à travers les gradients environnementaux. Il permet une comparaison entre deux sites, car il évalue la ressemblance entre deux relevés en faisant le rapport entre les espèces communes aux deux relevés et celles propres à chaque relevé. I = Nc / (N1 + N2 - Nc) où • Nc est le nombre de taxons communs aux stations 1 et 2 Cet indice I varie de 0 à 1 et ne tient compte que des associations positives. Si l’indice I augmente, un nombre important d’espèces se rencontre dans les deux habitats évoquant ainsi que la biodiversité inter habitats est faible (conditions environnementales similaires entre les habitats). Dans le cas contraire, si l’indice diminue, seul un faible nombre d’espèces est présent sur les deux habitats. Ainsi, les espèces pour les deux habitats comparés sont totalement différentes indiquant que les différentes conditions de l’habitat déterminent un turn-over des espèces importantes. ♦ Équivalent étranger : Jaccard index. |
Indice de similarité de Morisita-Horn | ♦ Contrairement aux indices de similarité de Sørensen et de Jaccard qui s’appliquent sur les données de présence-absence, l’indice de similarité de Morisita-Horn s’applique aux données quantitatives. Il permet d’évaluer la similarité entre les différents groupes et n’est pas influencé par la richesse spécifique et l’effort d’échantillonnage. (ai x bi) avec • da = Σai² / Na² Sa valeur est comprise entre 0 (communautés dissemblables) et 1 (similarité maximale). ♦ Équivalent étranger : Morisita-Horn index. |
Indice de Sørensen | ♦ Destiné à comparer des objets sur la base de la présence-absence d’espèces. Il donne un poids deux fois plus élevé à la double présence. β = Cs = (2a / 2a + b + c) * 100 où • a est le nombre d’espèces communes aux deux groupements comparés Cet autre indice mesure la similitude en espèces entre deux habitats et vient en complément de l’indice de Jaccard. ♦ Équivalent étranger : Sørensen index. |
Indice de spécialisation des communautés | ♦ Peut être utilisé comme indicateur de perturbation des habitats. Il est en effet étroitement corrélé au degré de fragmentation et de perturbation des habitats : ce coefficient est maximum dans les habitats les plus stables et les moins fragmentés et diminue lorsque la perturbation ou/et la fragmentation augmente. Il permet d’évaluer si les changements de la biodiversité sont directement liés à des modifications de l’occupation du sol. CSI = [ Σ (ai x SSIi) / N ] où • ai et SSIi sont respectivement les indices d’abondance et de spécialisation de l’espèce i CSI varie entre 0 et 1 tout comme l’indice de rareté relative. Quand CSI = 1, la communauté est composée d’individus des espèces les plus spécialisées. Quand CSI = 0, la communauté est composée d’individus des espèces les plus généralistes. |
Indice de teneur en eau de la végétation | ♦ Il est établit à partir de mesures de réflectance dans le proche infrarouge et dans le rouge. NDVI = (NIR - Rouge) / (NIR + Rouge) NDVI = (ρPIR- ρR) / (ρPIR +ρR) où • ρR est la réflectance dans la bande rouge La valeur du NDVI varie entre -1 (pas de végétation) et +1 (végétation abondante). > Le NDVI peut être corrélé à de nombreuses propriétés des plantes. Il a été, et est encore aujourd’hui, utilisé pour caractériser l’état de santé des plantes, pour repérer les changements phénologiques, pour estimer la biomasse verte et les rendements et dans bien d’autres applications. Les conditions atmosphériques et les fines couches nuageuses peuvent influencer le calcul du NDVI à partir de données satellitaires. Quand la couverture végétale est faible, tout ce qui se trouve sous la canopée influence le signal de réflectance qui sera enregistré. Il peut s’agir de sol nu, de litière végétale ou d’un autre type de végétation. Chacun de ces types de couvert du sol aura sa propre signature spectrale, différente de celle de la végétation qu’on souhaite étudier. ♦ Synonyme : Indice de Tucker. ♦ Équivalent étranger : Normalized difference vegetation index (NDVI). |
Indice de végétation par quotient | ♦ Égal au rapport entre les bandes du PIR et du rouge RIV = ρPIR / ρR où • ρR est la réflectance dans la bande rouge Son inconvénient, comme pour le précédent, est qu'il est très sensible aux variations atmosphériques, ainsi qu'à la contribution spectrale des sols. En outre, lorsque la végétation est très dense, la réflectance dans la bande rouge devient très faible, ce qui entraîne une saturation des valeurs de l'indice RVI. |
Indice des plantes immergées dans les lacs | ♦ Indice qui utilise les observations de plantes aquatiques recueillies par des plongeurs qualifiés, des plongeurs autonomes et des plongeurs en apnée, à l'aide de méthodes normalisées (de Winton et al, 2012). Les informations sur la structure et la composition des plantes immergées sont utilisées pour calculer trois indices :
Les indices de condition indigène et les indices d'impact invasif sont utilisés ensemble pour générer l'indice LakeSPI, qui fournit un indicateur global de la condition écologique d'un lac. Un indice élevé est souhaitable :
Référence internet : https://niwa.co.nz/our-science/freshwater-and-estuaries/lakespi-keeping-tabs-on-lake-health/how-lakespi-works ♦ Équivalent étranger : Lake Submerged Plant Indicators (LakeSPI). |
Indice diatomique |