♦ Algues microscopiques présentes dans les eaux, se multipliant par division cellulaire sous l'effet de la photosynthèse. Pratiquement, toutes ont la capacité de réaliser la photosynthèse, c'est-à-dire de fabriquer la matière organique nécessaire à leur développement. Le phytoplancton constitue le premier maillon de la chaîne alimentaire dont va dépendre le reste des organismes vivants supérieurs. Il est également à la base de la production en oxygène dissous. La quantité de phytoplancton étant difficile à mesurer, il est possible de quantifier leur biomasse à travers leur activité chlorophyllienne.

> La chlorophylle a est un pigment photosynthétique permettant de quantifier la biomasse totale de phytoplancton actif (par opposition à la matière végétale morte quantifiée par les phéopigments). Ce paramètre permet de savoir si la production primaire est suffisante pour assurer une bonne oxygénation des eaux, jusqu’à un certain seuil à partir duquel il est témoin d’un dysfonctionnement du milieu. En effet, en cas de prolifération algale facilitée entre autres par des apports en sels nutritifs importants, la teneur en chlorophylle a est supérieure aux valeurs attendues en raison d’une activité biologique croissante.
On parle de blooms phytoplanctoniques pouvant engendrer une désoxygénation importante des eaux lors de la dégradation de la matière organique produite.
On parle de processus d’eutrophisation des eaux. Ainsi, le suivi de la chlorophylle a paraît important pour juger (1) si les ressources trophiques sont suffisantes dès ce premier maillon de la chaîne alimentaire, (2) si le phytoplancton est suffisamment productif pour favoriser l’oxygénation des eaux et (3) à l’inverse, si les biomasses observées ne sont pas excédentaires, au risque d’entraîner des surconsommations d’oxygène lors de la dégradation de ces populations phytoplanctoniques.

> À partir de la concentration des différents pigments, il est possible de juger de la vitalité du phytoplancton à l’aide du rapport suivant :

             Matière vivante exprimée par la concentration en chlorophylle a
Vitalité = ─────────────────────────────────────────
                Matière morte exprimée en concentration de phéopigments

Si ce rapport est supérieur à 1, cela implique que le phytoplancton est productif et que les conditions environnantes lui conviennent pour son développement. S’il est inférieur à 1, cela indique qu’il y a plus de matières végétales mortes que vivantes, traduisant des conditions du milieu moins favorables à leur survie et une production en oxygène dissous moins performante.

♦ Équivalent étranger : Phytoplankton.